Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Col5a3Q9JLI2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Col5a3Q9JLI2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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