Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr5Q9JLF7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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