Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms