Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms