Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Riox1Q9JJF3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms