Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SelenofQ9ERR7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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