Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r46Q9EQ45 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 508.6 ms