Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms