Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms