Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp4cQ9D7F7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms