Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rtl8cQ9D6I0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms