Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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