Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl11Q9CXW4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms