Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Utp23Q9CX11 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Utp23Q9CX11 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Utp23Q9CX11 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Utp23Q9CX11 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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