Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tdrd12Q9CWU0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms