Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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