Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms