Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1aQ99L02 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pagr1aQ99L02 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pagr1aQ99L02 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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