Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TriobpQ99KW3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms