Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Klhl22Q99JN2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms