Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smc1bQ920F6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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