Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Med28Q920D3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms