Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39cQ8VE09 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms