Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nek9Q8K1R7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek9Q8K1R7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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