Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrit1Q8K099 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrit1Q8K099 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms