Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc43a2Q8CGA3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms