Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdc34Q8CFI2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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