Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp27Q8CEG8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp27Q8CEG8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms