Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nup88Q8CEC0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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