Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufl1Q8CCJ3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms