Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms