Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssc5dQ8BV57 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms