Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms