Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ChfrQ810L3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChfrQ810L3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms