Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms