Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pcsk9Q80W65 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Pcsk9Q80W65 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Pcsk9Q80W65 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pcsk9Q80W65 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.9 ms