Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smap2Q7TN29 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms