Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms