Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ecm29Q6PDI5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ecm29Q6PDI5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ecm29Q6PDI5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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