Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms