Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Krt40Q6IFX3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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