Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pkp4Q68FH0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pkp4Q68FH0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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