Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc18Q640L5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc18Q640L5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms