Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa17Q64016 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Defa17Q64016 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa17Q64016 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms