Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tfap2bQ61313 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms