Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms