Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim58Q5NCC9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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