Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shank3Q4ACU6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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