Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lin28bQ45KJ6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lin28bQ45KJ6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lin28bQ45KJ6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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