Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms